Можно ли ограничить отца в родительских правах, если он находиться на СВО?

Добрый день, теоретически можно, запрета нет, практически вряд ли.
Ограничение родительских прав производится судом (статья 73 СК РФ);
В соответствии со статьей 215 ГПК РФ суд обязан приостановить производство по делу в случае участия гражданина, являющегося стороной в деле, в боевых действиях в составе Вооруженных Сил Российской Федерации, других войск, воинских формирований и органов, созданных в соответствии с законодательством Российской Федерации, в проведении контртеррористической операции, призыва его на военную службу по мобилизации, заключения им контракта о добровольном содействии в выполнении задач, возложенных на Вооруженные Силы Российской Федерации, выполнения им задач в условиях чрезвычайного или военного положения, вооруженного конфликта, если такой гражданин не заявил ходатайство о рассмотрении дела в его отсутствие.
Вряд ли гражданин, участвующий в СВО имеет какую то возможность получить судебное извещение и направить ходатайство о рассмотрении дела в его отсутствие. Тем более он должен быть еще согласен на это.